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Accueil > A noter > Séminaires à l’IPS2

Jeudi 8 Juin à 10h00

- Dr Arnaud Droit

Professeur agrégé à l’Université Laval
Directeur de la plate-forme de Bioinformatique du Centre de Recherche du CHU de Québec - Université Laval

« Les nouveaux défis pour l’intégration et l’analyse des données génomique »

 

Résumé :
Les technologies multi-Omiques (Génomique, Transcriptomique, Protéomique, Métabolomique, etc…) constituent aujourd’hui une approche robuste pour mieux comprendre des mécanismes biologiques. Toutefois, ces expériences génèrent une très grande quantité de données (Big data) hétérogènes et complexes à interpréter, nécessitant ainsi le développement de nouveaux outils spécifiquement adaptés. Afin de répondre à ces chalenges, nous développons, au sein de l’équipe de recherche en biologie computationnelle basée au centre de recherche du CHU de Québec, de nouvelles approches afin de répondre 1) aux problèmes statistiques reliés à l’intégration de données provenant de sources expérimentales diverses (e.g. par apprentissage machine, réseaux de corrélations, etc.), 2) aux défis reliés à l’utilisation optimale des données massives publiques par l’utilisation de stratégie de fouille de données et de web sémantique, 3) à la conception de stratégies d’interprétation et de visualisation de données provenant de sources diverses, afin d’extraire le plus d’informations pertinentes et de faciliter leur interprétation. Au cours de cette présentation, je survolerai les différentes approches développées et implémentées dans divers projets de recherche, tels que le cancer de la prostate et la sclérose en plaques, et les méthodes d’approche génomique utilisées afin de mieux caractériser des zones de régulations du génome humain (fine mapping, metagene). Enfin, je présenterai aussi un outil basé sur la technologie ElasticSearch développé au laboratoire, qui permettra à terme de croiser l’information disponible en bio-informatique.

 

- Bâtiment 630 : salle rouge

Invitation : Marie-Laure Martin-Magniette