Genopole Evry


Accueil > Plateformes > Plateforme Transcriptomique > Projects


Running National and European projects

  • BAP2014_41 - ReOmicAB « Réponses métabolomiques et transcriptomiques à la disponibilité en Azote chez Brachypodium ». Coord. : T.Girin, INRA-IJPB Versailles.
  • CIVIB, 2014-2017- Déterminisme des propriétés épidémiques et du pouvoir pathogène du phytoplasme de la Flavescence Dorée de la vigne,Coord. X. Foissac, INRA Villenave d’Ornon.
  • AAP BAP 2014 ; MitoTrad « Analyse de la traduction mitochondriale ». Coord. : H . Mireau INRA-IJPB Versailles
  • AAP BAP 2014 ; NitroPath « Nitrogen nutrition and pathogen susceptibility : priming by metabolism ». Coord. : M. Fagard INRA-IJPB Versailles.
  • MAGNIPHY : Identification des gènes impliqués dans la morphologie florale des espèces de la famille des Magnolideae par RNA-seq. Coord. : H. SAUQUET, ANR JC 2013.
  • PIRANa : Petals in Ranunculaceae : developmental and genetic origin of shape diversity and evolutionary role by RNA-seq, Coord. : C. Damerval, AAP-IDEEV 2013.
  • Evometonicks : Evolutionary genomics of nickel hyperaccumulation in plants, Coord. : S. Merlot, ANR bioadapt 2013-
  • SYBIOPOP : A systems biology approach to improve poplar biorefinery feedstock by deciphering the genetic architecture of lignocellulosic biomass production and quality, Coord. : V. SEGURA, ANR JC 2013.
  • CytoPheno : Cyto-nuclear co-adaptation and plant adaptive phenotypes. Coord. : F. Budard (INRA Versailles), ANR PROGRAMME BIOADAPT, 2012-2014
  • No Stress Wall : Novel information on the effect of drought STRESS on the cell WALL. Coord. : Lucau-Danila Anca (UMR 1281 SADV, Université Lille), ANR PROGRAMME BIOADAPT, 2012-2015.
  • CharmFull : Characterization of the Meristematic FUnction of LEAFY in plants, F. Parcy, ARN Blanc 2012- 2014.


Running Developments

- Ultralow Input micro-dissected TotalRNA samples for RNA-seq sequencing experiment (collaboration JD Faure/B. Dubreucq IJPB Versailles)
- RIP-seq for non polyA RNA targets (collaboration H. Mireau IJPB Versailles)
- Test on C1™ Single-Cell Auto Prep system for plant cell


Facilities on collaboration 2003-2014

We analyzed 800 samples/year on average (all technologies) corresponding to 36 projects/year in collaboration. Since 2003, we have published an average of 10 publications/year which amounts to 105 in 10 years.

- For collaborations : see « Available technologies » part